Το εκπαιδευτικό πρόγραμμα της Ε.Σ.Τ.Α. διαρκεί 18 μήνες και περιλαμβάνει την Κοινή Φάση Σπουδών (8 μήνες), Πρακτική Άσκηση (3 μήνες), τη Φάση Εξειδίκευσης για κάθε Τμήμα (4 μήνες) και την εκπόνηση Τελικής Εργασίας (2 μήνες). Ακολουθεί η Φάση Προετοιμασίας  για τις θέσεις προορισμού (1 μήνας)

Στη Φάση Εξειδίκευσης λειτουργούν τα ακόλουθα Τμήματα :

• Οργάνωσης και Διοίκησης
• Οικονομικής Διαχείρισης
• Μεταναστευτικής Πολιτικής
• Πολιτικής Προστασίας